污水廠生產運轉功用主要由廠部、運轉部（包含中心控制室和各工段）、動力維修部（包含電工班和維修組）與化驗室完成，由運轉部指導各工段的運轉作業。
污水廠的動力與設備保護系統主要由日常保護，定時檢修，故障維修與改進維修組成。
除污水處理系統運轉外，運轉部人員亦負責設備的日常保護，包含日常巡檢及簡易慣例保護，如加潤滑油、清潔、清換過濾器、小部件的緊固調整設備等（一般完成作業任務時刻約為0.5小時）。動力維修部主要負責設備的定時檢修，故障維修及改進維修。實驗室行政上由排水公司直屬，實際上設在污水廠，并在廠長的協調下與運轉部緊密配合進行作業。污水進廠的調度由廠部在運轉部幫忙下與排管處及泵站進行。水質監控目標按《城鎮污水處理廠污染物排放規范》GB18918-2002和建廠時批準的環境影響評價陳述確定的級別履行，各檢測項目的檢測周期參照《城市污水處理廠運轉、保護及其安全技術規程》CJJ60-94履行。
